培元中學（二中）校友總會以「團結校友，連繫母校；互助互勵，關心社群，宏揚『真理自由 服務』之校訓精神。」為目標，設有會員大會、監事會及理事會推動會務。本會除製作網頁、定期出版會訊及舉辦活動外，又設立「培元中學（二中）校友總會獎學金」，獎勵學業及操行良好之母校在學學生。